Biopolttoaine on kallista
Biopolttoaineiden käyttö nostaa liikenteen polttonosteiden hintaa. Biopolttoaineet eivät pysty kilpailemaan bensiinin ja dieselin kanssa, koska niiden tuottaminen on selvästi perinteisiä polttoaineita kalliimpaa. Korkeamman hinnan vuoksi EU on pyrkinyt lisäämään niiden käyttöä asettamalla liikenteelle 5,75 prosentin suuruisen biopolttoaineen käyttövelvoitteen vuoteen 2010 mennessä. Tärkeimmät biopolttoaineet ovat etanoli ja biodiesel. Niiden tuotanto kilpailee perinteisen elintarviketuotannon kanssa viljelyalasta. Biopolttoaineiden tuottaminen on edullisinta siellä, missä tuotanto-olosuhteet ovat parhaat.